La nostra scuola fu fondata nel 1908 con il nome di “Regio Istituto Magistrale Statale". Inizialmente era sita lì dove oggi sorge la Scuola Elementare e Materna omonima.

La maggior parte degli alunni, pendolare, veniva ospitata dal vicino convitto “Regina Margherita”, la cui rettrice dirigeva anche l’istituto, che inizialmente trattava materie tecniche.

Quando l’istituto divenne indipendente dal convitto, un preside prese il posto della rettrice. Nel 1946, anno in cui venne proclamata la Repubblica, l’istituto prese il nome dalla fondatrice del convitto, diventando così "Istituto Magistrale Regina Margherita".

Solo nel 1968 l'Istituto è stato trasferito in quella che oggi è la nostra scuola, in Viale Regina Margherita, nel pieno centro della Città dei Papi.